Plateforme protéomique (Lille)
Les 4 « work-packages ou WP » sont directement concernés par des approches et technologies de protéomique.
L’un des objectifs principaux de ParaFrap était d'acquérir des spectromètres de masse et de former des doctorants et post-doctorants à travers les workshops de protéomique spécifiquement adaptées à la parasitologie moléculaire.
Ainsi, la Plateforme de Protéomique et Peptides Modifiés (P3M) de l’Institut Pasteur de Lille a été inaugurée le 17 avril 2014. Cette plateforme, co-financée par le LabEx ParaFrap, le FEDER-Region Nord Pas de Calais et la Communauté Urbaine Lille Métropole est hébergée dans les laboratoires de l’Institut Pasteur de Lille. P3M propose les technologies de pointe en matière d’analyse protéomique. Cette plateforme qui offre les services et compétences d’experts est ouverte à la communauté scientifique (recherche académique et médicale). Les expertises proposées sont :
P3M permet de développer une technologique qui est également un élément déterminant pour notre attractivité de chercheurs/chercheuses, pour le transfert de technologies/divulgation des connaissances, pour la valorisation des découvertes par des industriels.
Inauguration de la plateforme du 17 avril 2014
Site internet de la plateforme
Plateforme métabolique (Bordeaux)
L'étude des perturbations métaboliques de cellules malades, génétiquement modifiées ou traitées par des inhibiteurs d'enzymes/médicaments est un enjeu majeur pour la compréhension du fonctionnement cellulaire ou du disfonctionnement cellulaire, pour la validation de cibles thérapeutiques etc.
Le développement récent de nouvelles méthodes de mesures par Résonance Magnétique Nucléaire (RMN), ainsi que de nouvelles méthodes pour l'analyse et l'interprétation des données complexes générées par spectrométrie RMN, font de ces approches des alternatives intéressantes à la spectrométrie de masse (MS) mais peuvent être aussi utilisés en combinaison avec des approches de MS pour les analyses métabolomiques. Le groupe de Bordeaux dirigé par Frédéric Bringaud (P3) est en relation étroite avec une plateforme de RMN ayant une expertise de longue date en Spectrométrie RMN, notamment pour l'étude des produits finaux excrétés par les métabolismes glucidiques et d'acides aminés de parasites.
La plateforme a acquis un nouveau spectromètre RMN avec un financement de ParaFrap et du Conseil Régional d'Aquitaine, afin d'étendre son expertise à des analyses quantitatives de métabolites intracellulaires de parasites unicellulaires. Cet équipement est opérationnel depuis Juillet 2015, avec un ingénieur dédié à son utilisation et sa maintenance. La moitié du temps d'utilisation de cet équipement est réservé à la communauté ParaFrap, à coût préférentiel.
Plateforme de séquençage (Université Aix-Marseille)
Le LabEx ParaFrap a participé au financement des équipements de séquençage de l’ADN de l’unité INSERM U906. L’utilisation de ces appareils est ouverte aux membres du LabEx pour les besoins de leurs projets. Le coût d’utilisation est dépendant du niveau d’expertise demandé. Les analyses réalisables sur la plateforme sont les suivantes :
Matériel disponible :
Predoctoral and Postdoctoral positions - Barcelona, Spain Project Leader: Alfred Cortés, PhD - Barcelona Institute for Global Health Hospital Clínic - Universitat de Barcelona Positions: A predoctoral and two...
PhD Position Perpignan, France Project Leader Ronaldo DE CARVALHO AUGUSTO (CPJ, UPVD), principal supervisor (50%) Jérôme BOISSIER (PU, UPVD), PI (50%) Project: Unveiling the Dark Secrets of Roommate Parasites: A Study...
PostDoc position : Saeij Lab, Davis, California, USA The Saeij lab (https://saeijlab.faculty.ucdavis.edu/) at the University of California, Davis, is currently looking for several postdoctoral scholars to work on...
PostDoc position : Identify new repository molecules against Cryptosporidium, Tours, France The lab seeks to hire a highly motivated candidate to work on the identification of new repository molecules against...
Emerging Leader Research Fellow, Oxford Brookes University, UK The Oxford Brookes University offers an opportunity to develop an independent research group in molecular parasitology/protistology through a...
PostDoc position : Gene regulation/ DNA low complexity regions-DNA binding proteins, Montpellier, France The post-doc project aims to investigate the role of Low Complexity Regions in regulation of gene expression in P....
Short-Term Scientific Missions (STSMs) within the OneHealthdrugs (CA21111) network 1st CALL for applications 2023 The 1st STSM Call of the Action CA2111 OneHealthdrugs is launched. Short Term Scientific Mission...
PostDoc position : Cross-talk between stress response and infection in dendritic cells at Institut Pasteur Lille, France We seek to hire a highly motivated candidate to work on the role of the Unfolded Protein...
[Publication] Les derniers travaux de Rania Najm, Hiba El Hajj, Maryse Lebrun & leurs collègues sont publiés dans PNAS. Les auteurs apportent des connaissances importantes sur les acteurs moléculaires de l'invasion des bradyzoïtes et...
Le LabEx ParaFrap vous souhaite plein de bonheur, de santé, de science et de succès pour 2023. Première actualité du réseau cette année : les webinaires ParaFrap reprennent en 2023, comme les années précédentes, tous les deuxième jeudi du...
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