Coordinateurs : Alain Dessein, Mohamed-Ali Hakimi
Participants : Pied, Dessein/Marquet, Hakimi, Delauw, Blandin, Marion
De nos jours, le séquençage à haut débit ouvrent plusieurs opportunités telles que le séquençage rapide du génome à coût faible, les transcriptomes ou les régions régulatrices (petits ARN, anti-sens, non codantes ou microARN) dans différents organismes (hôtes, vecteurs et parasites). En combinant ces technologies avec les approches génétiques, ParaFrap explorera le génome du parasite, du vecteur ainsi que le génome humain en recherchant des variants génétiques, des séquences régulatrices ou les ARNs qui affectent la virulence du parasite, des hôtes ou du vecteur susceptibles d'être la cause de la pathologie.
Description du travail
a. Analyse Génétique des facteurs hôtes (Hakimi, Dessein/Marquet, Pied)
Les microARNs des hôtes affinent l'expression d'une grande partie du génome, et jouent un rôle important dans la réponse innée. Les parasites interfèrent avec les fonctions des ARN d'interférence (ARNi) des hôtes pour remodeler leur environnement cellulaire et causer la pathologie. En utilisant les ARN du séquençage à haut débit, nous allons étudier l'expression de la reprogrammation dynamique et réversible de l'ensemble des protéines dans la cellule en analysant les microARN au cours de l'infection de l'hôte par des parasites suivants : Toxoplasme et Leishmania. Nous allons séquencer les effecteurs de virulence produits par les parasites qui interfèrent avec la machinerie de l'ARN hôte. Une grande partie des facteurs génétiques de l'hôte prédisposant aux maladies parasitaires comme la leishmaniose, le paludisme sévère ou trypanosomiase, correspondent à des variants rares associés à des risques génétiques élevés. Le génome du séquençage à haut débit sera utilisé pour identifier les variants rares présentant des risques génétiques élevés prédisposant à la maladie causée par Leishmania braziliensis (leishmaniose cutanée) au Brésil, L. donovani (Kala Azar) au Soudan, P. falciparum (paludisme grave) chez les enfants au Mali. L'analyse sera menée dans la cohorte de populations précédemment collectées par les membres de ParaFrap.
b. L'analyse génétique des facteurs vecteurs (Blandin)
Les moustiques augmentent d'une manière puissante la réponse immunitaire qui limitent le nombre des parasites, et, est déterminée majoritairement par des facteurs génétiques. Nous allons dépister les facteurs génétiques qui sont responsable de la résistance des moustiques aux parasites du paludisme, grâce à deux techniques : la cartographie fine et caractérisation de QTL (Quantitative Trait Locus) et l'étude de l'expression d'allèle spécifique à l'aide d'ARNi. En outre, nous développerons de nouveaux outils génétiques permettant la caractérisation fonctionnelle de tous les gènes choisis dans le génome des moustiques.
c. L'analyse génétique des facteurs parasites (Bringaud, Delauw, Mazier)
Les parasites, y compris plasmodia et trypanosomatidae, montrent une panoplie de voies qui sont rarement trouvés ensemble dans un seul organisme. Différentes techniques telles que : la Métabolomique associée aux approches génétiques inverse (KO, RNAi et / ou la surexpression de gènes) permettra la mise en place du réseau métabolique globale pour comprendre :
Dans ce projet, nous nous concentrerons sur la biosynthèse des lipides chez P. falciparum et le métabolisme des glucides / acides aminés ainsi que leur lien avec le métabolisme des lipides chez les trypanosomes. Les outils et les approches métabolomiques seront disponibles à tous nos partenaires ParaFrap. Les relations entre l'hôte et son parasite sont souvent très spécifiques à l'espèce et la base moléculaire de cette spécificité n'est pas connue. L'équipe de Dominique Mazier va exploiter les données de la séquence génomique pour rechercher les différences dans la spécificité de l'hôte entre P. falciparum et les parasites de chimpanzés qui sont étroitement liées en se focalisant sur les éléments parasitaires qui sont spécifiques et essentiels pour les interactions avec les hôtes. Une approche de remplacement de gène sera ensuite utilisée pour analyser la contribution des facteurs candidats spécifiques de P. falciparum avec la cellule hôte. Delauw et al. vont utiliser chez les rats, la cartographie génétique et le criblage génétique par génétique inverse pour identifier les facteurs génétiques des parasites contrôlant le locus de résistance appelé Toxo-1. Le but est de définir les variantes alléliques de ces facteurs de parasites et de comprendre l'influence de ces combinaisons de la toxoplasmose chez son hôte.
Success for ParaFrap students at MPM2023 Parafrap students won numerous awards at the MPM 2023, Woods Hole USA, 17-21 September 2023. A warm congratulations to all ! Parul Sharma (2nd year PhD under the...
Predoctoral and Postdoctoral positions - Barcelona, Spain Project Leader: Alfred Cortés, PhD - Barcelona Institute for Global Health Hospital Clínic - Universitat de Barcelona Positions: A predoctoral and two...
PhD Position Perpignan, France Project Leader Ronaldo DE CARVALHO AUGUSTO (CPJ, UPVD), principal supervisor (50%) Jérôme BOISSIER (PU, UPVD), PI (50%) Project: Unveiling the Dark Secrets of Roommate Parasites: A Study...
PostDoc position : Saeij Lab, Davis, California, USA The Saeij lab (https://saeijlab.faculty.ucdavis.edu/) at the University of California, Davis, is currently looking for several postdoctoral scholars to work on...
PostDoc position : Identify new repository molecules against Cryptosporidium, Tours, France The lab seeks to hire a highly motivated candidate to work on the identification of new repository molecules against...
Emerging Leader Research Fellow, Oxford Brookes University, UK The Oxford Brookes University offers an opportunity to develop an independent research group in molecular parasitology/protistology through a...
PostDoc position : Gene regulation/ DNA low complexity regions-DNA binding proteins, Montpellier, France The post-doc project aims to investigate the role of Low Complexity Regions in regulation of gene expression in P....
Short-Term Scientific Missions (STSMs) within the OneHealthdrugs (CA21111) network 1st CALL for applications 2023 The 1st STSM Call of the Action CA2111 OneHealthdrugs is launched. Short Term Scientific Mission...
PostDoc position : Cross-talk between stress response and infection in dendritic cells at Institut Pasteur Lille, France We seek to hire a highly motivated candidate to work on the role of the Unfolded Protein...
[Publication] Les derniers travaux de Rania Najm, Hiba El Hajj, Maryse Lebrun & leurs collègues sont publiés dans PNAS. Les auteurs apportent des connaissances importantes sur les acteurs moléculaires de l'invasion des bradyzoïtes et...
Actualités du LabEx
Autres actualités
Project Manager: Yoann MILLERIOUX
Contact
![]() |
@ParaFrap #ParaFrap |
© 2023. Tous droits réservés by MLCOM
Notre site LabEx ParaFrap utilise des cookies pour réaliser des statistiques de visites, partager des contenus sur les réseaux sociaux et améliorer votre expérience. En refusant les cookies, certains services seront amenés à ne pas fonctionner correctement. Nous conservons votre choix pendant 30 jours. Vous pouvez changer d'avis en cliquant sur le bouton 'Cookies' en bas à gauche de chaque page de notre site. En savoir plus
Ce site utilise des cookies pour assurer son bon fonctionnement et ne peuvent pas être désactivés de nos systèmes. Nous ne les utilisons pas à des fins publicitaires. Si ces cookies sont bloqués, certaines parties du site ne pourront pas fonctionner.
Ce site utilise des cookies de mesure et d’analyse d’audience, tels que Google Analytics et Google Ads, afin d’évaluer et d’améliorer notre site internet.
Ce site utilise des composants tiers, tels que NotAllowedScript6575f974ef534ReCAPTCHA, Google NotAllowedScript6575f974eef01Maps, MailChimp ou Calameo, qui peuvent déposer des cookies sur votre machine. Si vous décider de bloquer un composant, le contenu ne s’affichera pas
Des plug-ins de réseaux sociaux et de vidéos, qui exploitent des cookies, sont présents sur ce site web. Ils permettent d’améliorer la convivialité et la promotion du site grâce à différentes interactions sociales.
Ce site web utilise un certain nombre de cookies pour gérer, par exemple, les sessions utilisateurs.